Có nhiều nguyên nhân để nhân viên của một công ty nộp đơn xin nghỉ việc. Bên cạnh những lý do từ chính nhân viên thì các nguyên nhân từ chính sách làm việc của công ty cũng là điều đáng bàn. Các nhà chuyên môn đã đưa ra những nguyên nhân cơ bản tạo ra tâm lý bất mãn, mất động lực làm việc của nhân viên như sau:
Thu nhập thấp hơn mức chuẩn: Nếu mức lương của nhân viên thấp hơn mức đáng ra họ được trả theo vị trí, tính chất công việc và khả năng thực hiện công việc (tạm gọi là mức chuẩn) thì dần dần họ sẽ mất hứng thú với công việc.
Thu nhập không công bằng: Nếu nhân viên có kiến thức, kỹ năng, kinh nghiệm và đóng góp nhiều cho công ty nhưng mức lương không xứng đáng hay khi nhân viên biết được mức lương của họ ít hơn của một hay nhiều đồng nghiệp khác làm cùng công việc, họ sẽ thấy khó chịu và không hài lòng với lãnh đạo.
Chính sách khen thưởng, thăng tiến, đào tạo không rõ ràng: Những chính sách liên quan đến quyền lợi và tương lai của nhân viên nếu không được công khai và không được thực hiện rõ ràng, công bằng sẽ làm cho họ bất mãn và lo lắng cho tương lai.
Nhân viên không được giao đúng công việc. Khi được giao việc dưới khả năng hay không đúng chuyên môn, kinh nghiệm hay môi trường làm việc không phát huy tính sáng tạo, nhân viên dần sẽ cảm thấy nhàm chán và không muốn làm việc do không có nhiều cơ hội để thử thách khả năng.
Nhân viên bị kiểm soát quá gắt gao: Việc kiểu soát, theo dõi quá gắt gao và thiếu tế nhị sẽ khiến nhân viên thấy khó chịu và bất mãn.
Nhân viên không được hỗ trợ: Khi không được hỗ trợ đúng mức và đúng lúc để hoàn thành công việc, hay nhân viên không nhận được chỉ đạo cụ thể từ cấp trên, họ sẽ rất khó làm việc và cảm giác không được công ty quan tâm đúng mức.
Nhân viên bị thử thách liên tục. Một số nhân viên do hoàn thành công việc quá xuất sắc, đã "được" sếp liên tục giao cho những chỉ tiêu cao và khó hơn. Những nhân viên đó cảm giác rằng sếp không bao giờ hài lòng với thành quả của họ dù họ đã làm tốt công việc.
Sếp "bắt" nhân viên nhận lỗi thay cho mình: Nếu nhà quản lý thường xuyên không nhận lỗi khi phạm sai lầm và đưa nhân viên ra "gánh tội" trước sếp cao hơn hay đối tác sẽ làm cho nhân viên không phục và dẫn đến bất mãn với sếp và công ty.
Hệ thống phục vụ nội bộ không tốt: Hệ thống cồng kềnh, thủ tục nội bộ phức tạp sẽ làm nhân viên không hài lòng và triệt tiêu hưng phấn làm việc của nhân viên. Các công ty mà những phòng ban được lập ra không phải để hỗ trợ nhau mà là để kiểm tra và làm khó nhau sẽ làm cho nhân viên mệt mỏi.